Sulla sua sommità si conservano le basi di una massiccia torre circolare, posta all'interno di una struttura triangolare, costruita dai romani. Probabilmente la torre veniva utilizzata come faro o avamposto di segnalazione per il porto di "Vada Sabatia", diventato nell'età imperiale un riferimento fondamentale nei traffici terrestri e marittimi della Liguria occidentale.
Sulle basi della torre romana è stata costruita in epoca medioevale una torre quadrata, che per analogia strutturale con la Torre d'Ere, costruita sulla terraferma, sembra aver fatto parte di un complesso sistema difensivo a protezione di questo tratto di mare.

Nell'alto medioevo l'isola è interessata da vicende sociali e religiose simili a quelle delle altre isole liguri. Secondo la tradizione in questo periodo vi si sarebbe rifugiato S. Eugenio, vescovo di Cartagine in fuga dall'Africa, ma oggi ritenuto più probabilmente un omonimo eremita.
La chiesa paleocristiana del V-VI sec. costruita su un terrazzamento nel versante nord-orientale dell'Isola sembra abbia ospitato le spoglie di S. Eugenio.

Nel 992 il vescovo di Savona fondò sul versante sud-occidentale dell'isola, un ampio edificio a due navate.
A dirigere il monastero furono chiamati i monaci di Lerins, che rimasero sull'isola almeno fino al 1346, oltre cioè il 1252, quando il sarcofago di S. Eugenio, proclamato patrono di Noli, fu trasportato nella cattedrale di S. Paragorio.